Стратификацией называют один из методов, способствующих лучшей всхожести семян. Семена японского клена требуют длительной стратификации. Для прохождения стратификации семян необходимы определенные условия: благоприятные температура и влажность окружающей среды. Семена, закладываемые на стратификацию, предварительно необходимо обеззараживать. Можно замочить на 0, 5 часа в 0, 5% растворе марганцовки. Затем промыть в нескольких водах комнатной температуры. Просушить, уложить в полиэтиленовые мешочки и разместить на верхней полке холодильника. Семена бонсай клена необходимо стратифицировать таким образом от двух до трех месяцев.